Photographe, Françoise Huguier a sillonné le monde et plus particulièrement l'Afrique.

Elle a été deux fois lauréate de la Villa Médicis hors les murs pour ses livres Sur les traces de l'Afrique fantôme et En route pour Behring (prix au World Press 1993). En 1994, elle a créé la première biennale de la photographie africaine à Bamako. Elle a été, en 2011, la directrice artistique de la biennale Photoquai.

En 2012, elle a reçu le prix de la Photographie de l'académie des Beaux-Arts. En 2014, une rétrospective lui a été consacrée à la Maison européenne de la photographie à Paris. En 2016, elle a présenté l'exposition "L'Élégie de la Traversée : de 1982 à 2015" au musée d'histoire de Séoul et a publié Virtual Seoul.

Françoise Huguier a été experte associée à la mise en place du projet culturel de la Société du Grand Paris.